一、分離分析藥物的組分含量：由于 藥劑常含有 組分，色譜方法是既能分離又能定量的方法。如脂溶性維生素片，含有鉻維生素，有C18柱及含1%碳酸銨的甲醇 流動相。一次即可將各維生素B6、D1、A、E同時分離并定出含量。又如止痛藥或退燒藥也可用此法分離并測得各組分的含量。
      二、藥物生產中進行中間控制：生產抗菌素時，首先要了解發酵液中的主體與付產物的存在情況。例如：青霉素、四環素、頭孢子菌素、紅霉素、柔紅霉素、慶 霉素等的發酵產物，均可用C18柱和甲醇及緩沖液配制的流動相或用離子對法，分析主體及其收產物的含量。對普魯卡因酰胺、茶堿等可進行主體含量的測定，對硝酸甘油可測定主體含量及其降解產物，以便保證藥物的熱量。
      三、分析藥物在體內的殘量： 是近來研究新藥效能很主要的內容之一，如冬凌草甲素是植物中的一組分，有抗癌效果，但是毒性大。測定其在血清中含量很重要，現在可用C18柱及甲醇水為流動相，測定處理后的血清樣品，即可得到血中的含量。如磺胺類藥品在血清及尿中含量也不允許太大，可用C18柱及酸性乙醇為流動相，測定含量后，則可估計最合適的用藥劑量。又如四環素、巴比妥酸、止痛藥、退燒藥、護糖尿病的藥物等，在血或尿中的含量都可用C18柱用甲醇、水為流動相來測定含量。因此，反相色譜法應用范圍極廣。
      四、 測定藥物在各種器官中的代謝產物，特別是研究藥物的代謝產物在血清中存在的情況。如測血清中的酮酸及戊二酸。測尿中代謝產物 為方便，不需要繁鎖的預處理。因為研究尿中的組分能鑒別病人的代謝功能，對病理研究或監床診斷均具有重要的參考價值。
       千百年來，中國的中醫藥世代相傳，在疾病的治療上也顯示出神奇的療效 ，在世界醫藥中占有重要的地位。但中藥成分的復雜性和多樣性也同時制約了中藥制劑的發展及在臨床上的應用，中藥品種不斯推陳出新 ，中藥的質量卻還遠沒有科學量化，這一切都需要一種精密的分析和檢測儀器。筆者查閱資料綜述了 HPLC法在中藥制劑分析方面的廣泛應用，其具有分離性能好 、適用范圍廣、分析速度快、選擇性好、靈敏度高、樣品用量少等優點。隨著與質譜、串聯質譜等聯用技術的逐步發展與完善 ，高效液相色譜法必將在中藥鑒定、中藥活性成分分析、中藥及其制劑生產的質量監控等方面起到重要的作用，成為分離、鑒定和含量測定的首選手段，有著廣泛的應用前景。近年來 ，HPLC法在儀器、檢測器、固定相等方面都有很大的發展 ，這大大促進了在中、西藥的藥物分析應用，尤其是對于中藥這一醫藥學的偉大寶庫 ，在制定含量這一質量指標時有困難 ，而 HPLC法可以解決這方面的難題 。但每一種分析技術均有其使用范圍和方法的局限性 ，現在主要是 色譜 一 色譜聯用、色譜光譜聯用、高效液相色譜 一 質譜聯用，還有柱切換技術以及高效液相色譜傅立葉變換紅外吸收光譜聯用等高效液相色譜與其他技術的聯用是高效液相色譜今后的主要發展方向 ，它也將是今后質量規范化 、國際化的重要途徑。